Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPER4Q7RTX7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CATSPER4Q7RTX7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms