Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP1Q7RTM1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms