Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBR3Q6ZT12 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
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