Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms