Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms