Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGMBQ6NW40 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGMBQ6NW40 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms