Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3HQ6NTF7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms