Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms