Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms