Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF3Q5VWG9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms