Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRNL1Q5VV63 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms