Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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LRRC38Q5VT99 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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LRRC38Q5VT99 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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LRRC38Q5VT99 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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LRRC38Q5VT99 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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LRRC38Q5VT99 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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LRRC38Q5VT99 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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LRRC38Q5VT99 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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LRRC38Q5VT99 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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LRRC38Q5VT99 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC38Q5VT99 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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LRRC38Q5VT99 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC38Q5VT99 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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