Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms