Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HES3Q5TGS1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms