Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms