Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AKAP4Q5JQC9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms