Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB4PQ58FF6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSP90AB4PQ58FF6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms