Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDK2Q58EX2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms