Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB6CQ53S08 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6CQ53S08 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms