Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms