Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms