Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTXN3Q4LDR2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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