Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms