Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UVSSAQ2YD98 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms