Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC27Q2M243 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms