Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RTL8BQ17RB0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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