Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRNQ16849 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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