Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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