Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
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FOXD1Q16676 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
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FOXD1Q16676 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
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FOXD1Q16676 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
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FOXD1Q16676 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
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FOXD1Q16676 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
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FOXD1Q16676 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
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