Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FXNQ16595 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FXNQ16595 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
FXNQ16595 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FXNQ16595 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms