Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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