Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK5Q16478 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms