Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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SSX1Q16384 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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SSX1Q16384 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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SSX1Q16384 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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SSX1Q16384 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SSX1Q16384 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SSX1Q16384 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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SSX1Q16384 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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SSX1Q16384 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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