Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms