Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA6Q15825 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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