Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 IRF2-201ENST00000393593 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.938e-10■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.368e-7■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-6■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 AC132217.1-201ENST00000430034 373 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.871e-323■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 FGFR4-215ENST00000513423 445 ntTSL 215.05■□□□□ -01e-8■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.87■□□□□ 0.611e-6■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 PI4KAP1-208ENST00000619742 1787 ntTSL 217.17■□□□□ 0.341e-6■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 PI4KAP1-207ENST00000618794 2553 ntTSL 1 (best)16.99■□□□□ 0.311e-6■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 PI4KAP1-206ENST00000617243 2340 ntTSL 516.75■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-6■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.352e-10■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 EIF2AK1-202ENST00000422786 782 ntTSL 312.52□□□□□ -0.412e-10■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.055e-6■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.055e-6■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.757e-7■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.157e-7■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.974e-11■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.84e-11■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 TPI1-202ENST00000396705 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.34e-11■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)22.68■■□□□ 1.221e-6■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.981e-36■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.981e-36■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.981e-36■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.423e-7■■■□□ 17.2
PCBP1Q15365 IDUA-205ENST00000506561 692 ntTSL 226.3■■□□□ 1.85e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 IDUA-208ENST00000509948 796 ntTSL 322.97■■□□□ 1.275e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 IDUA-203ENST00000502910 714 ntTSL 322.67■■□□□ 1.225e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 IDUA-204ENST00000504568 586 ntTSL 321.6■■□□□ 1.055e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 IDUA-209ENST00000514192 697 ntTSL 321.52■■□□□ 1.045e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 NELFA-205ENST00000416258 2188 ntTSL 520.07■□□□□ 0.83e-8■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 NELFA-213ENST00000467661 1707 ntTSL 1 (best)18.54■□□□□ 0.563e-8■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 NELFA-209ENST00000453740 738 ntTSL 317.79■□□□□ 0.443e-8■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 NELFA-212ENST00000463820 2495 ntTSL 217.2■□□□□ 0.343e-8■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 FBXO31-208ENST00000636077 660 ntTSL 524.36■■□□□ 1.491e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.111e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 FBXO31-204ENST00000565593 2717 ntTSL 519.54■□□□□ 0.721e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.671e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 FBXO31-202ENST00000561664 305 ntTSL 515.72■□□□□ 0.111e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-11■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 LGALS3BP-210ENST00000588508 882 ntTSL 216.53■□□□□ 0.242e-10■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.613e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)16.45■□□□□ 0.223e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.063e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.261e-10■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 FAM78A-202ENST00000372269 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.551e-10■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 FAM78A-201ENST00000247295 4560 ntTSL 211.36□□□□□ -0.591e-10■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 CCNI-205ENST00000507788 595 ntTSL 418.51■□□□□ 0.556e-9■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.533e-6■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.463e-6■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.313e-6■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.33e-6■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.013e-6■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.22e-6■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 931 ntTSL 1 (best)18.59■□□□□ 0.572e-6■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.592e-6■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 BCL2L2-PABPN1-202ENST00000556100 655 ntTSL 314.97□□□□□ -0.017e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.377e-7■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 MBOAT7-207ENST00000449249 707 ntTSL 522.67■■□□□ 1.222e-6■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.243e-6■■■□□ 17.1
PCBP1Q15365 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.863e-10■■■□□ 17
PCBP1Q15365 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.024e-6■■■□□ 17
PCBP1Q15365 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.174e-6■■■□□ 17
PCBP1Q15365 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.024e-6■■■□□ 17
PCBP1Q15365 MICALL2-204ENST00000467394 2080 ntTSL 221■□□□□ 0.953e-6■■■□□ 17
PCBP1Q15365 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.964e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.54e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.174e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 C2-217ENST00000497706 1609 ntTSL 516.62■□□□□ 0.253e-9■■■□□ 17
PCBP1Q15365 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.671e-10■■■□□ 17
PCBP1Q15365 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-10■■■□□ 17
PCBP1Q15365 MFGE8-205ENST00000558018 1989 ntTSL 218.01■□□□□ 0.471e-10■■■□□ 17
PCBP1Q15365 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-10■■■□□ 17
PCBP1Q15365 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.22e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.042e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.942e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.942e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.882e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.812e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.82e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ACD-211ENST00000602850 883 ntTSL 519.72■□□□□ 0.752e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 KLHL21-205ENST00000496707 824 ntTSL 1 (best)18.72■□□□□ 0.592e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 NDUFB10-203ENST00000565031 958 ntTSL 218.1■□□□□ 0.492e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ACD-212ENST00000602860 1858 ntTSL 517.87■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 TAL1-206ENST00000481091 504 ntTSL 317.24■□□□□ 0.352e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ACD-207ENST00000602622 2526 ntTSL 217.06■□□□□ 0.322e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ATP5H-205ENST00000582341 979 ntTSL 213.74□□□□□ -0.212e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ACD-208ENST00000602656 714 ntTSL 213.45□□□□□ -0.262e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 NDUFB10-205ENST00000570172 495 ntTSL 312.48□□□□□ -0.412e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 XPO5-206ENST00000455285 758 ntTSL 311.94□□□□□ -0.52e-7■■■□□ 17
PCBP1Q15365 ACD-204ENST00000602382 662 ntTSL 511.88□□□□□ -0.512e-7■■■□□ 17
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