Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms