Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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RAB35Q15286 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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RAB35Q15286 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RAB35Q15286 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RAB35Q15286 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RAB35Q15286 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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RAB35Q15286 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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