Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECTIN1Q15223 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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