Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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BRD3Q15059 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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BRD3Q15059 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
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BRD3Q15059 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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BRD3Q15059 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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BRD3Q15059 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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BRD3Q15059 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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