Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
GAPVD1Q14C86 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
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