Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPARCL1Q14515 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms