Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBM39Q14498 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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