Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTTNQ14247 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms