Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
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SPIDRQ14159 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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