Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4AQ14139 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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