Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VGLL4Q14135 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms