Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL9A3Q14050 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL9A3Q14050 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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