Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX3Q13761 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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