Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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FHL3Q13643 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FHL3Q13643 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FHL3Q13643 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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FHL3Q13643 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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FHL3Q13643 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FHL3Q13643 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FHL3Q13643 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FHL3Q13643 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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FHL3Q13643 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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FHL3Q13643 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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FHL3Q13643 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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FHL3Q13643 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FHL3Q13643 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FHL3Q13643 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FHL3Q13643 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FHL3Q13643 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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